Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00597Q9H2U6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00597Q9H2U6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms