Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
DUSP9Q99956 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP9Q99956 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP9Q99956 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP9Q99956 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP9Q99956 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP9Q99956 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP9Q99956 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP9Q99956 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP9Q99956 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms