Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LMTK3Q96Q04 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LMTK3Q96Q04 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms