Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NLRP3Q96P20 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP3Q96P20 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms