Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFAP53Q96M91 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFAP53Q96M91 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms