Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CMTM5Q96DZ9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CMTM5Q96DZ9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms