Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG4CQ96DT6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG4CQ96DT6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms