Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAF2Q96CS3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms