Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RFT1Q96AA3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms