Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NGDNQ8NEJ9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NGDNQ8NEJ9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms