Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LTBP4Q8N2S1 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LTBP4Q8N2S1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
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