Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF554Q86TJ5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms