Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP54Q7Z3B4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms