Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM47EQ6ZV65 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM47EQ6ZV65 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms