Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT5

MYOM3, Myomesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM3Q5VTT5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MYOM3Q5VTT5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
MYOM3Q5VTT5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms