Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ESCO2Q56NI9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms