Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SP6Q3SY56 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SP6Q3SY56 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SP6Q3SY56 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms