Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL40Q2TBA0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL40Q2TBA0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms