Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLPPQ16740 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLPPQ16740 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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