Protein–RNA interactions for Protein: Q16643

DBN1, Drebrin, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBN1Q16643 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DBN1Q16643 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms