Protein–RNA interactions for Protein: Q16566

CAMK4, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type IV, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK4Q16566 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CAMK4Q16566 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CAMK4Q16566 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms