Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCARF1Q14162 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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