Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAPSNQ13702 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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