Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATRQ13535 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ATRQ13535 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ATRQ13535 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ATRQ13535 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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