Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TOP3AQ13472 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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