Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PMS2P3Q13401 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms