Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SOS1Q07889 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SOS1Q07889 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms