Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EGR3Q06889 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms