Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GABPAQ06546 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABPAQ06546 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms