Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PSME1Q06323 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms