Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 LINC02259-202ENST00000565543 438 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AP001793.2-201ENST00000580267 780 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CACNB1Q02641 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 FAM221A-201ENST00000344962 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 IL36G-201ENST00000259205 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 CCL11-201ENST00000305869 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 LINC00469-201ENST00000321800 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AC022405.1-201ENST00000559841 516 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 CCT6P1-203ENST00000443108 1170 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AC109466.1-203ENST00000524297 1083 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CACNB1Q02641 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms