Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DSC2Q02487 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms