Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN2Q02246 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN2Q02246 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN2Q02246 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN2Q02246 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN2Q02246 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN2Q02246 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN2Q02246 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN2Q02246 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN2Q02246 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTN2Q02246 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CNTN2Q02246 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTN2Q02246 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms