Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPCQ01831 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPCQ01831 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XPCQ01831 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XPCQ01831 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XPCQ01831 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XPCQ01831 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XPCQ01831 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XPCQ01831 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XPCQ01831 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
XPCQ01831 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XPCQ01831 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XPCQ01831 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XPCQ01831 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XPCQ01831 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XPCQ01831 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
XPCQ01831 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPCQ01831 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPCQ01831 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPCQ01831 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPCQ01831 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPCQ01831 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPCQ01831 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPCQ01831 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPCQ01831 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPCQ01831 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
XPCQ01831 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPCQ01831 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
XPCQ01831 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPCQ01831 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPCQ01831 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPCQ01831 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPCQ01831 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XPCQ01831 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPCQ01831 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPCQ01831 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPCQ01831 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPCQ01831 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPCQ01831 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPCQ01831 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPCQ01831 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPCQ01831 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPCQ01831 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPCQ01831 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPCQ01831 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPCQ01831 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPCQ01831 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPCQ01831 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XPCQ01831 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
XPCQ01831 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPCQ01831 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPCQ01831 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPCQ01831 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPCQ01831 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
XPCQ01831 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
XPCQ01831 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPCQ01831 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPCQ01831 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XPCQ01831 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms