Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IRF9Q00978 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms