Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CLTCQ00610 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLTCQ00610 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms