Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SPCS3P61009 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SPCS3P61009 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SPCS3P61009 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SPCS3P61009 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SPCS3P61009 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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SPCS3P61009 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SPCS3P61009 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SPCS3P61009 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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SPCS3P61009 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SPCS3P61009 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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