Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms