Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SLC25A1P53007 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms