Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRP9P49458 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRP9P49458 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRP9P49458 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms