Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRA2P47869 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms