Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATRXP46100 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATRXP46100 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATRXP46100 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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