Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZEB1P37275 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZEB1P37275 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms