Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ATP5C1P36542 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP5C1P36542 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms