Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA4P35212 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA4P35212 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA4P35212 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA4P35212 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA4P35212 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA4P35212 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA4P35212 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA4P35212 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA4P35212 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA4P35212 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GJA4P35212 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GJA4P35212 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GJA4P35212 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJA4P35212 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJA4P35212 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJA4P35212 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJA4P35212 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJA4P35212 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJA4P35212 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJA4P35212 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GJA4P35212 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA4P35212 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA4P35212 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA4P35212 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA4P35212 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA4P35212 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA4P35212 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA4P35212 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA4P35212 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA4P35212 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA4P35212 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA4P35212 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA4P35212 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA4P35212 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA4P35212 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA4P35212 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA4P35212 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GJA4P35212 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GJA4P35212 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms