Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTF2E1P29083 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms