Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EPHA1P21709 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms