Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EFNA1P20827 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms