Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CREB1P16220 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CREB1P16220 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CREB1P16220 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CREB1P16220 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms