Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BMP3P12645 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BMP3P12645 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BMP3P12645 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BMP3P12645 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BMP3P12645 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BMP3P12645 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BMP3P12645 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BMP3P12645 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BMP3P12645 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BMP3P12645 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BMP3P12645 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BMP3P12645 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BMP3P12645 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BMP3P12645 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BMP3P12645 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BMP3P12645 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BMP3P12645 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BMP3P12645 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BMP3P12645 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BMP3P12645 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BMP3P12645 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BMP3P12645 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BMP3P12645 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BMP3P12645 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BMP3P12645 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BMP3P12645 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BMP3P12645 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BMP3P12645 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BMP3P12645 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BMP3P12645 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BMP3P12645 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BMP3P12645 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BMP3P12645 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BMP3P12645 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BMP3P12645 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BMP3P12645 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BMP3P12645 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BMP3P12645 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BMP3P12645 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BMP3P12645 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BMP3P12645 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BMP3P12645 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BMP3P12645 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BMP3P12645 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BMP3P12645 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BMP3P12645 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BMP3P12645 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BMP3P12645 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BMP3P12645 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BMP3P12645 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BMP3P12645 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BMP3P12645 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BMP3P12645 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BMP3P12645 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BMP3P12645 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BMP3P12645 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BMP3P12645 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BMP3P12645 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BMP3P12645 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BMP3P12645 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BMP3P12645 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BMP3P12645 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BMP3P12645 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BMP3P12645 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BMP3P12645 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BMP3P12645 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BMP3P12645 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BMP3P12645 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BMP3P12645 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BMP3P12645 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BMP3P12645 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BMP3P12645 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BMP3P12645 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms